流式细胞术是一种对溶液中单细胞或微粒进行高速、多参数定量分析的技术。其核心原理是：细胞经荧光染料或抗体标记后，在鞘液包裹下单行通过激光检测区。仪器同步检测每个细胞产生的前向散射光（反映细胞大小）、侧向散射光（反映细胞颗粒复杂度）以及特定波长的荧光信号（反映细胞成分或功能），从而实现基于物理和生化特性的大规模细胞分群、计数与分析，广泛应用于免疫学、肿瘤学等领域。
流式细胞术的检测通道主要分为这两大类：
散射光通道：前向散射角（FSC）通道：检测激光正前方的小角度散射光。其信号强度主要反映细胞的相对大小和体积。侧向散射角(SSC)通道：检测与激光束垂直方向的90°散射光。其信号强度主要反映细胞内部的颗粒复杂度、胞内结构和细胞表面粗糙度。这两个参数是细胞的固有物理特性，无需染色即可获得，是进行细胞初始分群（如区分淋巴细胞、单核细胞、粒细胞）的基础。
荧光通道：当细胞携带的荧光染料或荧光标记抗体被特定波长的激光激发后，会发射出波长更长的荧光信号。仪器通过一系列滤光片（带通、长通、短通）将不同波长的荧光信号导入不同的荧光通道进行检测。每个荧光通道对应一种或一类特定的荧光素（如FITC、PE、APC等），用于定量分析细胞上表达的目标蛋白（如表面抗原、胞内因子）、核酸含量（如DNA）、离子浓度或酶活性等生化信息。
常见流式实验结果图
流式结果图常见的分为散点图、直方图和等高线图。
散点图
形式：二维图形，每个点代表一个细胞，其位置由两个参数决定（如FSC-A/SSC-A，或两个荧光通道）。
结果分析：细胞在横纵坐标的位置代表其相应的荧光强度，越远离原点荧光越强。同时可以对细胞进行分群，从总细胞中一步步圈出目标细胞。
核心用途：最基础、最常用，主要用于圈门和显示两个参数间的相关性，通过观察细胞在二维空间的聚集情况，来划分不同的细胞亚群。
直方图
形式：单参数一维图形，横轴是一个通道的荧光强度或散射光强度，纵轴是细胞数量。
结果分析：细胞信号越强，在横坐标离原点越远，相同信号的细胞越多，在纵坐标上离原点越远。
核心用途：展示单一参数在所有细胞中的连续分布，常用于分析某个标志物的表达水平（如阴/阳性分群），或比较不同样本间同一参数的变化。
等高线图
形式：二维图形，类似于地图上的等高线，同一线条上的点具有相同的细胞密度。
结果分析：密集的闭合环形圈，代表一个细胞亚群聚集的中心，即细胞密度最高的区域，这相当于散点图中细胞点最密集的“云团核心”。单个闭合环形圈代表一个主要细胞群体，多个则代表存在多个不同的细胞亚群。等高线越密集常表示一个均质性高、表型一致的细胞群，等高线越稀疏通常表示一个异质性高、表型分散的细胞群。
核心用途：展示细胞群体在两个参数上的密度分布。线条越密集，表示该区域的细胞密度越高。它能更直观地显示细胞群的“中心”和“边界”，尤其适用于观察主要细胞群的分布和稀有细胞群的位置。
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