血清沉淀主要是纤维蛋白等蛋白、磷酸盐、脂类等经冻融后析出，导致血清内出现沉淀现象，该现象与血清品质无关，大部分品牌的血清都会有这种情况，不会影响细胞培养，只是培养时可能偶尔观察到血清沉淀，注意区分血清沉淀和细胞污染即可。血清沉淀较多时可以将血清静置后，尽量吸走上清，下部有大量沉淀的血清可以2000rpm离心5min后取上清与之前取的上清混合使用。
血清反复冻融、高温融化、融化不均、灭活等因素均有可能导致沉淀增多，血清融化时应尽量在4℃融化，每隔一段时间摇晃一下。